Laurin, 2001-- Phylogenetic Taxonomy

["Jaime A. Headden" <qilongia@yahoo.com>]

This is for those who didn't get it on the PhyloCode Mailing List ... I 
appologize to those who
received this more than twice.

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Laurin, M. 2001. L'Utilisation de la taxonomie phylogénétique en paléontologie: 
Avantages et
inconvénients. _Biosystema (Systématique et Paléontologie)_ 19: 197-211. [in 
French]

  This papers bears on the discussion of phylogenetic taxonomy, and is a study 
in theory. I don't
have a complete handle on the paper, as it is written in French, and it is not 
as easily workable
as Italian or Spanish are for me. I am slowly translating it, however; the 
English sections are
translated using Babelfish, with corrections made by me, but these are minor 
(e.g., "taxons" in
French is Babel-fished as "make taxes" or similar parse). It does make sense, 
in a way. I am
cross-posting because of the relevance to both lists.


Résumé - Le problème de l'âge d'origine des taxons a récemment soulevé beaucoup 
d'intérêt.
Malheureusement, la taxonomie linnéenne est assez mal adaptée à des discussions 
de ces sujet. à
cet égard, la taxonomie phylogénétique comporte de nombreux avantages par 
rapport à la taxonomie
linnéenne. Elle facilitie la discussion sur l'âge d'origine des taxons car elle 
clarifie
l'identité des clades. Elle permet également de déduire l'étendue des lignées 
fantômes dans les
divers taxons. Cependant, ses avantages les plus importants sont la plus grande 
clarté et la plus
grande stabilité qu'elle confère aux taxonomies, que les phylogénies actuelles 
soient appelées à
changer ou non. Ceci résulte des principes de synonymie, d'homonymie et de 
priorité qui ont été
proposés par les adeptes de la taxonomie phylogénétique. En revanche, en 
taxonomie linnéenne, de
tels principes n'existant pas pour les taxons de rang supérieur (au-delà du 
rang familial). Ceci,
ainsi que l'impossibilité de délimiter un taxon supra-spécifique à l'aide d'un 
type, a conduit à
une profusion de synonymes et d'homonymes dans les taxonomies linnéennes. 
Enfin, l'adoption de la
taxonomie phylogénétique devrait améliorer la réputation de la taxonomie hors 
du cénacle de
systématiciens professionnels. Quelques exemples du fonctionnement de la 
taxonomie phylogénétique,
telle qu'elle est exposée dans le PhyloCode, sont donnés.

[Summary [Abstract] - The problem of the age of the origin of taxa recently 
raised much interest.
Unfortunately, Linnaean Taxonomy is rather badly adapted to these discussions. 
In this respect,
phylogenetic taxonomy comprises many advantages compared to Linnaean Taxonomy. 
It facilitates the
discussion on the age of origin of taxa because it clarifies the identity of 
the clades. It also
makes it possible to deduce the extent from the ghost lineages in the various 
taxa. However, its
most significant advantages are greatest clearness and the greatest stability 
which it confers on
taxonomies, that current phylogenies have to change or not. This results from 
the principles of
synonymy, homonymy and priority which were proposed by the followers of 
phylogenetic taxonomy. On
the other hand, in Linnaean Taxonomy, with such principles not existing for 
taxa with higher rank
(beyond the family rank). This, as well as impossibility of delimiting a 
supraspecific taxon using
a type, led to a profusion of synonyms and homonyms in taxonomies linnéennes. 
Lastly, the adoption
of phylogenetic taxonomy should improve the reputation of taxonomy out of the 
coterie of
professional systematicians. Some examples of the operation of phylogenetic 
taxonomy, such as it
is exposed in the PhyloCode, are given.]

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Conclusions

La taxonomie phylogénétique comporte donc de nombreux avantages en 
paléontologie, non seulement
pour les paléontologues eux-mêmes, mais également pour les néontologues qui 
veulent utiliser la
littérature paléontologique. L'utilisiation de cette taxonomie rendra la 
littérature
paléontologique plus facile à utiliser pour tous ceux qui veulent connaître 
l'âge des divergences
entre les taxons actuels (ou éteints), ou simplement étudier l'évolution de la 
view dans un cadre
phylogénétique clair. Elle stabilisera également la taxonomie en instaurant des 
principes de
synonymie, d'homonymie et de priorité de sorte que chaque clade ne correspondra 
qu'à un seul nom,
et vice-versa. Les systématiciens en général, et les paléontologiques en 
particulier ne peuvent
qu'y gagner.

[Phylogenetic taxonomy thus comprises many advantages in paleontology, not only 
for the
paleontologists themselves, but also for the neontologists who want to use the 
paleontological
literature. The utiliziation of this taxonomy will make the literature 
paleontological easier to
use for all those which [sic] want to know the age of the divergences between 
extant taxa (or
extinct), or simply to study the evolution of the view within a phylogenetic 
framework clearly. It
will also stabilize taxonomy by founding principles of synonymy, homonymy and 
priority so that
each clade will correspond only to one name, and vice versa. Systematicians in 
general, and the
paleontological ones in particular can only there gain.]

  I'd guess Laurin's conclusions are quite plain. Thanks to Michel for sending 
me the paper, I
shall take much enjoyment in it translating [honestly!] and reading it.

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Jaime A. Headden

  Little steps are often the hardest to take.  We are too used to making leaps 
in the face of adversity, that a simple skip is so hard to do.  We should all 
learn to walk soft, walk small, see the world around us rather than zoom by it.

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